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  • 更加轻松地筛选出作用最好的药物分 子:AIDDISON™

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小分子药物的巨大影响

如今绝大多数可选药物都是小分子药物,仅由几百个或更少数量的原子组成。这些药物范围广泛,涵盖从常见非处方药(如阿司匹林),到用于治疗多种疾病(如癌症、糖尿病、自身免疫性疾病和呼吸道感染)的先进靶向治疗药物,占据了 90% 的全球药物销售额。[1]

然而,新型小分子药物的发现和开发流程会耗费大量时间和资金,通常需要投入十多年时间和高达 10 - 20 亿美元资金,而且 90% 的候选药物在临床试验中都会遭遇失败,这一数字着实令人震惊。[2]

幸运的是,人工智能 (AI) 可在加快药物发现方面发挥巨大潜力,使研究人员能够迅速识别最适合的分子。

你知道吗?

  • 90%

    的全球药物销售额都来自小分子药物 [1]

  • >20

    亿美元,这是每种新药物获得批准的平均成本 [2]

  • >1660

    亿个类药性小分子存在于化学宇宙数据库中 [3]

    药物化学家的日常探索工作

    发现新型小分子药物是一个漫长的迭代过程,需要仔细检验数千种化合物,才能识别出最合适的化合物。

    在药物发现流程中,生物学家首先要确定潜在药物靶点,比如在治疗疾病方面发挥关键作用的酶。之后,药物化学家会开始探索可改变靶点活性的小分子。除了引发所需的生物反应之外,这种化合物还必须具备多种其他重要的“类药性”特征,比如无毒性、可溶性、体内稳定性,以便确保其作为成功药物的功效。

    寻找潜在候选药物的传统方法包括高通量筛选,即利用自动化设备迅速筛选大量的小分子,进而识别以所需活性作用于靶点的苗头化合物。下一步是将这些苗头化合物转化为有望成为有效药物的先导化合物。这一流程通常被称为“苗头到先导”,涉及对苗头化学物进行一系列化学修饰,以提高其效力、选择性和其他类药性特征。

    “苗头到先导”流程通常会在化学合成、生物测试和计算机建模方面经过多次迭代,需要投入大量时间、资源和专业知识。此外,这些初始化合物有相当大一部分会在随后的研发阶段遭到弃用,原因是效力低下、具有不适合的类药性特征或在化学合成方面存在挑战。

    “药物发现领域中的一大挑战是,在初始阶段识别出理想类药性分子的可能性很低,”我们的 AI 和自动化部门负责人 Ashwini Ghogare 说道,“花费几个月时间尝试合成缺乏可行性或有利生物学特性的化合物,这会给我们带来很大风险。”

    Aiddison(TM)

           

    1660 亿个分子中找出一个

    数十年来,传统的计算化学方法在药物发现方面发挥了重要作用。例如,计算机辅助药物设计 (CADD) 会使用候选分子及其靶点的结构信息,以预测二者将如何相互作用。

    但是,猎药师目前正在转而采用其他策略以提高成功几率。AI 和机器学习模型可从庞大的数据集中获取不易察觉的深刻洞察,由此规避研究一些注定失败的化合物,以达到精简药物发现流程并节约时间和资源的目的。

    “计算化学家现在可采用超快的方法,在包含数十亿分子的虚拟化学空间中进行搜索,以寻找具有更好类药性概况的创新结构。”Ghogare 说道。

    据预计,化学宇宙数据库 GDB-17 中有 1664 亿个分子。[3] 但到目前为止,为寻找新型小分子药物而探索的化学空间只占一小部分——即使是这些庞大的虚拟库也仅仅触及了所有潜在结构的皮毛而已。  

    药物发现领域的利刃

    我们的全新 AIDDISON™ 药物发现软件充分利用 AI、机器学习和 CADD 方法的强大力量,为 AI 生成式方法、大型化学空间的虚拟筛选及“苗头到先导”的发现和优化工具提供了一站式服务。

    这款由 AI 提供支持的药物发现软件可让研究人员探索无限的化学空间,并激发有关全新化合物的想法。AIDDISON™ 有助于根据预测活性,迅速识别最佳类药性候选分子。该工具还包括来自我们 SYNTHIA™ 逆合成软件的合成可行性评分,用于预测是否有可能通过化学合成制造出化合物。

    “整合这些技术将会加快药物发现的速度,并找到更有可能取得成功的分子。”Ghogare 说道。

    适合所有规模的大数据

    但是,在药物发现领域充分利用 AI 和机器学习的力量,其实取决于是否有足够清晰的相关数据来训练这些模型,以便它们能提供有效的科学预测。

    AIDDISON™ 是具有以下特点的首款商用产品,囊括了在药物研发领域以实验方式生成的数据集中经过训练的机器学习模型。

    尽管大多数大型制药公司正在使用内部实验数据,以开发由 AI 提供支持的专有药物发现系统,但我们允许全球更广泛研究界(包括中小型制药企业)的科学家使用这些工具。

    “我们已使用专有数据训练这些机器学习模型,并将其内置到软件中,来提高成功找到适合候选分子的概率,”Ghogare 说道,“我们的客户还能使用他们自己的数据来训练这些模型,并将这些学习成果结合起来,以便更加出色地开展药物发现工作。”

    今天的发现成果:未来的基石

    “AIDDISON™ 犹如一把利刃,”Ghogare 说道,“将所有这些不同的技术整合到单一平台,是以更快速度和更低成本发现药物的制胜之道。”

    通过在一个易于使用的工具中同时引入传统计算化学与变革性 AI 和机器学习技术,我们希望 AIDDISON™ 可帮助猎药师尽快找到合适的分子。

    “通过将医疗保健领域的药物发现专业知识与生命科学领域的研发和客户导向型专业知识结合在一起,我们便能发挥独特的优势,积极创新和构建变革性产品,进而加快药物发现,”Ghogare 解释道,“最终,这将造福于患者。”

    我们的承诺

    2012 年,联合国制定了 17 个可持续发展目标 (SDG),以应对全球面临的环境、政治和经济方面的迫切挑战。3 年后,所有成员国都采纳了这些目标。我们承诺,我们的工作将有助于实现这些宏伟的目标。我们由 AI 提供支持的药物发现软件 AIDDISON™ 符合“目标 9:工业、创新和基础设施;具体目标 9.5:加强科学研究。”AIDDISON™ 利用 AI、机器学习和计算化学的力量,帮助药物化学家找到最具可行性的候选药物进行研发。这样不仅加快了药物发现的速度,最终还可帮助患者更快获得改变生活的新药物。

    深入了解

    让我们一起再次创造伟大

    在这种情况下,我们需要寻找自然智能!

    您是否相信,AI 可在药物发现领域发挥强大 力量?加入我们的团队,您即可助力研发下 一代软件,以加快发现有效的新药物,彻底 改变患者生活。

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    Your Intelligence for Artificial Intelligence. Your Intelligence for Artificial Intelligence.

    参考文献:

    [1] https://www.immpressmagazine.com/small-vs-big-understanding-the-differences-between-small-molecule-drugs-and-biologic-drugs/
    [2] https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211383522000521
    [3] https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ci300415d?src=getftr

     

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